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WinNonlin 培训讲义培训,培训讲义,讲义资料,培训资料
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WinNonlin 培训讲义
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【讨论】大家讨论一下：为什么要做多剂量试验阿？！
在临床前药代动力学中的多剂量和临床试验中的多剂量试验中，要有哪些药代参数？数值在那个范围里说明什么问题，如累积系数为怎样一个数值说明有累积？都有什么意义？说明什么问题？大家来讨论一下！当药物在临床上将连续多次应用时，需明确多次给药的药代动力学特征。根据研究目的，应考察药物多次给药后的稳态浓度（Css），药物谷、峰浓度的波动系数（DF），是否存在药物蓄积作用和/或药酶的诱导作用。
根据试验中测定的三次谷浓度及稳态血药浓度-时间数据，绘制多次给药后药-时曲线，求得相应的药代动力学参数，包括达峰时间（Tmax）、稳态谷浓度（Css_min）、稳态峰浓度（Css_max）、平均稳态血药浓度（Css_av）、消除半衰期（t1／2）、清除率（CL或CL/F）、稳态血药浓度-时间曲线下面积（AUCss）及波动系数(DF)等。
对试验结果进行分析，说明多次给药时药物在体内的药代动力学特征，同时应与单剂量给药的相应药代动力学的参数进行比较，观察它们之间是否存在明显的差异，特别在吸收和消除等方面有否显著的改变，并对药物的蓄积作用进行评价、提出用药建议谢谢楼上的战友！我想问一下累计系数R的意义？在什么范围内为无蓄积。我觉得这个参数好像与给药间隔和半衰期有关。这样一种蓄积我觉得是一种正常的情况，如果要在体内达到一种稳态的水平，这个系数肯定是要大于1的，就是说有蓄积。但和我们所认为的蓄积（好像这个“蓄积”是一个贬义词）不同。我有些困惑。我没有计算过累计系数R，我个人觉得这应该是是一个回归后得到的相关吸收，即多次给药，各次给药后谷浓度和给药间隔的相关系数，系数越接近1，说明相关系越好，说明有蓄积。如果相关性不好，则不能说明有蓄积。个人意见，不当之处，多多指教！A。多剂研究内容1．&&AUC0-τ,（药－时曲线下面积，τ是给药周期）2．&&Cmax（峰浓度）,Tmax（达峰时间），要求均为最后一次给药的药时曲线实测值。3．&&Cmin，即每次给药间隔的峰谷浓度。4．&&Cav，稳态时平均药物浓度，Cav＝AUC0-τ/τ。5．&&DF，波动系数，DF＝100％×（Cmax-Cmin）/Cav。6．&&AUC0－∞，AUC0－∞＝AUC0-t＋Ct/λz，Ct是最后一个可测定的药物浓度（实测值），λz是终末端消除速率常数，相当于WinNonLin软件中的AUCINF_obv。 T1/2也应报告于最终报告中（对应于WinNonLin软件中的HL_Lambda_z）。7．&&AUCt-∞（药时曲线外推面积）占全部药时曲线下面积，相当于WinNonLin中的（AUC (0-inf) %Extra）。此药代参数值一般要求小于20％。B．&&CL(或CL/F)和V（或V/F）*，血浆清除率和表观分布容积。蓄积比有几种不同计算方法：主要方法参见下图，还可以使用Cmax计算。（Accumulation_Index＝实际累积指数＝蓄积比）该值预测在稳态给药间隔某一时间的体内药量与第一次给药后相同时间的体内药量比值。
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求高手指教WinNonlin 软件中药动学参数的意义
求高手指教WinNonlin 软件中药动学参数的意义，具体每个分别代表什么？
Rsq_adjusted
No_points_lambda_z
Lambda_z_lower
Lambda_z_upper
HL_Lambda_z
AUCINF_obs
AUCINF_D_obs
AUC_%Extrap_obs
AUCINF_pred
AUCINF_D_pred
AUC_%Extrap_pred
AUMCINF_obs
AUMC_%Extrap_obs
AUMCINF_pred
AUMC_%Extrap_pred
MRTINF_obs
MRTINF_pred
请教一下 如何通过winnolin中的MRTINF_obs计算t1/2呢 给药途径为口服 胶囊剂
弱弱问一句 参数中没有半衰期 如何根据winnolin 给出参数求算口服给药途径的t1/2呢？
HL_Lambda_z 就是半衰期吧~
你好！Winnonlin软件计算得到的药动学参数中没有半衰期吗？
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【求助】老师给留的药动题，请喜欢药动的高手帮忙看看。&[精华]
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这个帖子发布于8年零59天前，其中的信息可能已发生改变或有所发展。
某药物单次口服23.158mg以后的血药浓度数据如下：Time(h)&&Con(ug/L)0.083
0.9 1、请用WinNonLin建立微分方程模型，并分析拟和的结果；2、你用什么方法确定参数的初始值？3、是否应考虑权重，请给出理由；==================================老师要求给出微分方程表示的模型，大家看看该怎么办？================================================如此具有鼓动性，那么加分鼓励一下吧。
不知道邀请谁？试试他们
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沉默的羔羊2000 edited on
shinernm 某药物单次口服23.158mg以后的血药浓度数据如下：Time(h)&&Con(ug/L)0.083
0.9 1、请用WinNonLin建立微分方程模型，并分析拟和的结果；2、你用什么方法确定参数的初始值？3、是否应考虑权重，请给出理由；==================================老师要求给出微分方程表示的模型，大家看看该怎么办？1、画个图，看看就基本确定是二室模型，写微分方程就简单了2、curve stripping就可以了3、看你的需要，可用可不用，一句话说不清楚
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1.我做的时候也认为是二室模型，但是用WinNonlin的有吸收二室模型拟合会出错，提示无法生成初值进行拟合。2.尝试用curve stripping后得到的初值进行拟合，可以得出结果。3.加权时，对Yhat进行加权得出的结果貌似比不加权要好一些。微分方程如下：C(T)=A*EXP(-ALPHA*T) +B*EXP(-BETA*T)+C*EXP(-K01*T)
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各位老大能否贴出用微分方程写的模型，只要把WinNonlin的PK text 贴出来就行了。老师说主要关心各个参数拟和的精度，Conditon number 和AIC, SBC.另外偏导的曲线也很有意义。To 一草亭：能否讲一下，如何用curve striping计算k12的初始值，以这个为例。To f_coco:C(T)=A*EXP(-ALPHA*T) +B*EXP(-BETA*T)+C*EXP(-K01*T) 这是二室macro参数的方程，是代数方程，不是微分方程吧？非常感谢，你进行了尝试，确实这个实例Winnonlin不能确定初值，不知你确定的初值是多少？我尝试了好几套初值，都可以看到拟和的非常好，但是参数值差别很大， 'V_F', 'k01', 'k10', 'k12', 'k21','Tlag' 这几个参数的如下初值：84.9,16,0.6,0.12,0.1,0.1得到参数如下：V1_F&&L&&85.036293K01&&1/h&&15.282830K10&&1/h&&0.651973K12&&1/h&&0.124242K21&&1/h&&0.103184Tlag&&h&&0.111141另外conditon number, AIC,SBC,以及偏导都不错，但是分析一下，就可以知道上面的参数结果是有问题的，也就是不符合常理。拟和的图如下：
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curve stripping就是对模型进行拟合的多项指数方程进行拆分求解。以A*EXP(-ALPHA*T) +B*EXP(-BETA*T为例，在T趋近于无穷大时A、C两项应趋近于0，所以可以通过尾端的点单独对B*EXP(-BETA*T)项进行拟合。将尾端的数据进行对数转换后，按Y=aX+b进行直线拟合，a即为斜率对应beta。在对分布相的拟合时，由于分布和消除混杂在一起，所以需将实测数据（对数转换过的）减去如上按直线拟合出来的外推至分布相的值，得到真实的分布相的数据，即A*EXP(-ALPHA*T)的数据，再按如上方法拟合即可。更详细的内容可以去看Gibaldi的《Pharmacokinetics》第二版，看原版的比看翻译的过瘾些。微分方程为：dCa/dt=-ka*CadC1/dt=ka*ca+k21*C2-K12*C1-K10*C1dC2/dt=K12*C1-k21*C2简而言之，房室中的C的变化率等于物质流入流出量之差。
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与您探讨，不一定正确：dCa/dt=-ka*Ca这个应该指吸收室的一级消除（输入）吧，若是用浓度做参数，那么这个微分方程的起始值如何确定？Ca(0)=?dC1/dt=ka*ca+k21*C2-K12*C1-K10*C1口服是否应该考虑生物利用度F?C1(0)=0dC2/dt=K12*C1-k21*C2周边室的微分方程C2(0)=0
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多谢f_coco给的参考书，应该指下面的这本吧。正好手头有这本书，以前没有好好学过，惭愧！粗翻了一下，没有找到关于curve stripping的内容，可能是我比较匆忙的缘故吧，能否告知在哪一章，谢谢。
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Ca(0)的初始值我不知道怎么确定，但是其它很多参数的初始值都是人工估计的（或者叫猜的）。口服如果有生物利用度F的值的话可以将F值代进去计算，否则算出的值都会加_F这个一个标志（例如WinNonlin），表示是静脉给药方式以外的途径给药的拟合结果。
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Appendix C Method of Residuals.应就是curve stripping法。如果我搞错了，请指正。
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f_coco Ca(0)的初始值我不知道怎么确定，但是其它很多参数的初始值都是人工估计的（或者叫猜的）。口服如果有生物利用度F的值的话可以将F值代进去计算，否则算出的值都会加_F这个一个标志（例如WinNonlin），表示是静脉给药方式以外的途径给药的拟合结果。若是写成药物量的微分，就不用考虑体积了吧。dA/dt=-ka*AA(0)=Dose起始值就是给药剂量
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f_coco Appendix C Method of Residuals.应就是curve stripping法。如果我搞错了，请指正。太好了，正是我需要的，非常感谢。
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V1=14.3 LV2=112 LCL1=57.3 L/hCL2=12.4 L/hKA=0.847 /h
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K01=0.847 /hK10=4.000 /hK12=0.867 /hK21=0.111 /h可能没有Tlag。ps. 你的方程是不是少了V2?
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没钱买WinNonLin的飘过
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shinernm 各位老大能否贴出用微分方程写的模型，只要把WinNonlin的PK text 贴出来就行了。老师说主要关心各个参数拟和的精度，Conditon number 和AIC, SBC.另外偏导的曲线也很有意义。To 一草亭：能否讲一下，如何用curve striping计算k12的初始值，以这个为例。To f_coco:C(T)=A*EXP(-ALPHA*T) +B*EXP(-BETA*T)+C*EXP(-K01*T) 这是二室macro参数的方程，是代数方程，不是微分方程吧？非常感谢，你进行了尝试，确实这个实例Winnonlin不能确定初值，不知你确定的初值是多少？我尝试了好几套初值，都可以看到拟和的非常好，但是参数值差别很大， 'V_F', 'k01', 'k10', 'k12', 'k21','Tlag' 这几个参数的如下初值：84.9,16,0.6,0.12,0.1,0.1得到参数如下：V1_F&&L&&85.036293K01&&1/h&&15.282830K10&&1/h&&0.651973K12&&1/h&&0.124242K21&&1/h&&0.103184Tlag&&h&&0.111141另外conditon number, AIC,SBC,以及偏导都不错，但是分析一下，就可以知道上面的参数结果是有问题的，也就是不符合常理。拟和的图如下：你这个拟合曲线是平滑曲线，应该不是通过微分方程的形式解出来的。
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gg816 V1=14.3 LV2=112 LCL1=57.3 L/hCL2=12.4 L/hKA=0.847 /h这个拟合线是折线，应该是微分方程形式解出来的，“数值算法”很关键。高手！从图形看，应该不是用WinNonlin做的，Matlab、Mathematica还是？？
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shinernm To 一草亭：能否讲一下，如何用curve striping计算k12的初始值，以这个为例。curve striping先估算macro contants，然后再转换一下就可以计算出k12,k21等参数了。代码有空再帖，还没有实际做。最近实在太忙了。关注此贴。
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忽然发现楼主这组数据很有意思。1、WinNonlin内建的二室模型口服without Tlag，Macro模型，无法直接拟合，初始值估算失败2、我的一个计算结果和shinernm以及gg给出的结果，参数有比较显著的差异。如下：（具体见附件）Parameter&&Unit&&ValueA&&μg/L&&Alpha&&1/h&&2.B&&μg/L&&97.Beta&&1/h&&0.ka&&1/h&&2.Parameter&&Unit&&Valuek10&&1/h&&1.k12&&1/h&&0.k21&&1/h&&0.t1/2Alpha&&h&&0.t1/2Beta&&h&&1.t1/2ka&&h&&0.V/F&&(μg)/(μg/L)&&45.CL/F&&(μg)/(μg/L)/h&&58.V2/F&&(μg)/(μg/L)&&44.CL2/F&&(μg)/(μg/L)/h&&30.Tmax&&h&&0.Cmax&&μg/L&&213.5638775AUC 0-t&&μg/L*h&&397.7330922AUC 0-∞&&μg/L*h&&397.746216AUMC&&μg/L*h^2&&773.1406106MRT&&h&&1.
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一草亭 edited on
三个软件的结果，注意WinNonlin自动给初始值是拟合不出来的，必须用户定义初始值。
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一草亭 edited on
mark一下，等着看分析！我用WinNonlin算的结果和ls几位也有不同。
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这么热闹呀，向前蹭一蹭~~从药时曲线看，是二室没有问题，由于是口服给药，若不考虑Tlag，如上面gg816的结果，则最高两个浓度点的拟和不好，所以我的模型加上了Tlag。在看药物的浓度变化超过了200倍（226/0.9），所以不考虑权重，过意不去，就武断地选观测值平方的倒数吧。LZ要求用微分方程，那就用微分方程写一个WinNonLin的用户自定义模型，如下：MODELremark
******************************************************remark
Developer:&&Kinginsunremark
Model Date:&&07-01-2009remark
Model Version:&&1.0remark
******************************************************remarkremark - define model-specific commands COMMANDS NFUNCTIONS 1NDERIVATIVES 3NPARAMETERS 6NCONSTANTS 1PNAMES
'V_F', 'K01', 'K12', 'K21', 'K10', 'Tlag'ENDremark - define temporary variablesTEMPORARY T=XDOSE=CON(1)END remark - define differential equations starting valuesSTART Z(1) = 0Z(2) = DOSEZ(3) = 0ENDremark - define differential equationsDIFFERENTIAL IF T le Tlag THEN DZ(1)=0 DZ(2)=0 DZ(3)=0ELSE DZ(1) = K01*Z(2)/V_F-K12*Z(1)+K21*Z(3)-K10*Z(1) DZ(2) = -K01*Z(2) DZ(3) = K12*Z(1)-K21*Z(3)ENDIFENDremark - define algebraic functionsFUNCTION 1F= Z(1)ENDremark - define any secondary parametersremark - end of modelEOM
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kinginsun edited on
一草亭 这个拟合线是折线，应该是微分方程形式解出来的，“数值算法”很关键。高手！从图形看，应该不是用WinNonlin做的，Matlab、Mathematica还是？？Mark，有意思。有时间研究一下。p.s. Matlab
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建好模型以后，输入给药剂量23158ug，设定1/Y^2权重，并指定这些参数的单位，初始值就偷些懒，借用前面人的结果，倒要照顾到它们间的关系。k01&&k10&&k12,k21而Tlag肯定要小于0.083（这是第一个测到浓度的点）V_F是中央室体积与生物利用度的比值，由于没有静脉给药的数据，所以F不能求算，只能算出V/F，用剂量23158ug与最高浓度226 ug/L得比值估算，约100L.设定好以后，“Start Modeling...”,PK TEXT（包含了所有的模型和参数信息）的结果如下：==========================================Input File: Workbook - [E:\Research\PBPK...\PK_Model_01.pwo]
07/01/2009
WINNONLIN NONLINEAR ESTIMATION PROGRAM
Version 5.2
Core Version 19Dec2006
Listing of input commands
COMMANDS NFUNCTIONS 1 NDERIVATIVES 3 NPARAMETERS 6 NCONSTANTS 1 PNAMES
'V_F', 'K01', 'K12', 'K21', 'K10', 'Tlag' END
1: TEMPORARY
3: DOSE=CON(1)
6: Z(1) = 0
7: Z(2) = DOSE
8: Z(3) = 0
10: DIFFERENTIAL
11: IF T LE TLAG THEN
12: DZ(1)=0
13: DZ(2)=0
14: DZ(3)=0
16: DZ(1) = K01*Z(2)/V_F-K12*Z(1)+K21*Z(3)-K10*Z(1)
17: DZ(2) = -K01*Z(2)
18: DZ(3) = K12*Z(1)-K21*Z(3)
21: FUNCTION 1
22: F= Z(1)
24: EOM NVARIABLES 2 PUNIT 'L','1/h','1/h','1/h','1/h','h' XNUMBER 1 YNUMBER 2 CONSTANTS 23158 METHOD 2
'Gauss-Newton (Levenberg and Hartley) ITERATIONS 50 WEIGHT -2 INITIAL 110,12,0.1,0.1,2,0.03 LOWER BOUNDS 0,0,0,0,0,0 UPPER BOUNDS 200,20,1,1,5,0.1 MISSING 'Missing' DATA 'WINNLIN.DAT' BEGIN
07/01/2009
WINNONLIN NONLINEAR ESTIMATION PROGRAM
ITERATION WEIGHTED_SS
0.3000E-01
6 CONDITION NO. = 113.4
0.9839E-01
0.4477E-01
6 CONDITION NO. = 54.73
0.9496E-01
0.5632E-01
6 CONDITION NO. = 44.91
0.9354E-01
0.5783E-01
6 CONDITION NO. = 35.02
0.9382E-01
0.6064E-01
6 CONDITION NO. = 34.84
0.9953E-01
0.7530E-01
6 CONDITION NO. = 21.52
0.7710E-01
6 CONDITION NO. = 21.89
0.7638E-01
6 CONDITION NO. = 24.01
0.7769E-01
6 CONDITION NO. = 25.28
0.7788E-01
6 CONDITION NO. = 24.36
0.7786E-01
6 CONDITION NO. = 24.25
CONVERGENCE ACHIEVED
RELATIVE CHANGE IN WEIGHTED SUM OF SQUARES LESS THAN
0.7786E-01
07/01/2009
WINNONLIN NONLINEAR ESTIMATION PROGRAM
STANDARD_ERROR
UNIVAR_CI_LOW
UNIVAR_CI_UPP
PLANAR_CI_LOW
PLANAR_CI_UPP
07/01/2009
WINNONLIN NONLINEAR ESTIMATION PROGRAM
*** VARIANCE - COVARIANCE MATRIX OF THE ESTIMATES ***
*** CORRELATION MATRIX OF THE ESTIMATES ***
*** EIGENVALUES OF (Var - Cov) MATRIX ***
EIGENVALUE
0.1851E+06
0.2601E-01
0.1471E-02
Condition_number=
0.1122E+05
07/01/2009
WINNONLIN NONLINEAR ESTIMATION PROGRAM
*** SUMMARY OF NONLINEAR ESTIMATION ***
STANDARDIZED
-0.3037E-01
-0.5566E-01
-0.1922E-01
0.3824E-01
CORRECTED SUM OF SQUARED OBSERVATIONS =
WEIGHTED CORRECTED SUM OF SQUARED OBSERVATIONS =
SUM OF SQUARED RESIDUALS =
SUM OF WEIGHTED SQUARED RESIDUALS = 0.150131
S = 0.136990
8 DEGREES OF FREEDOM
CORRELATION (OBSERVED,PREDICTED) = 0.9978
WEIGHTED CORRELATION (OBSERVED,PREDICTED) = 0.9986
AIC criteria =
SBC criteria =
NORMAL ENDING
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先看拟和以后各参数的精度，CV%均小于12，说明精度很高。
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conditon number=0.E6, 说明模型稳定，另外从偏导也可以看出。
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拟和以后的曲线
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我用3P97权重为1/C*C的结果，
PHARMACOKINETIC PARAMETERS──────────────────────────────────────────────────────────────────────────────
Standard Error──────────────────────────────────────────────────────────────────────────────
294.146480
(mg/kg)/(ug/ml)
T 1/2 alpha
t 1/2 beta
(ug/ml)*hour
420.937740
mg/kg/hour/(ug/ml)
223.724411──────────────────────────────────────────────────────────────────────────────
[ANY KEY] to Continue
(mg/kg)/(ug/ml)
T 1/2 alpha
t 1/2 beta
(ug/ml)*hour
420.937740
mg/kg/hour/(ug/ml)
223.724411──────────────────────────────────────────────────────────────────────────────
[ANY KEY] to Continue
T 1/2 alpha
t 1/2 beta
t1/2 Ka是什么含义？
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huaxia78dragon edited on
你上面第三贴中有解释。
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V_F是中央室体积与生物利用度的比值，由于没有静脉给药的数据，所以F不能求算，只能算出V/F，用剂量23158ug与最高浓度226 ug/L得比值估算，约100L.v-F有什么意义呢？
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huaxia78dragon edited on
多谢各位的帮忙，从上面大家贴出的结果，已经可以让我交差了。相关微分方程如下：(1) dA/dt=-ka*A(2) dC1/dt=ka*A*F/V+k21*C2-K12*C1-K10*C1(3) dC2/dt=K12*C1-k21*C2本以为自己已经理解了，但是老师的一句问话，又把我弄懵了，他问若C1代表中央室的浓度，那么C2代表什么地方的浓度，我说“代表周边室的浓度呀”，然后就被狠狠批了·#￥%…！难道我错了？谁能给解释下，谢谢。
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shinernm edited on
Usually, amount unit will be used, though concentration unit will not compromise. dA1/dt=-ka*A1dA2/dt=ka*A1+k21*A3-(k12+k10)*A2 (Please not, there is no F)dA3/dt=k12*A2-k21*A3k10=CL1/V1k12=CL2/V1k21=CL2/V2Good luck
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gg816 edited on
我用3P97处理完数据,得到三种模型和三种权重的输出结果,但是我不知道怎样选择房室模型和权重,请高手指教啊.3P97的使用说明上关于说明上房室数的选择这样写的:关于房室数的选择 可根据 F 检验和 AIC 值选择房室数. 对于相同的权,当F 检验有显著意义(P&0.05 或 P&0.01)时, 应取 AIC 值较小的房室数,当 F 检验无显著意义(P&0.05)时, 则取房室数少者为宜. 但输出结果中没有F和P值,不知道怎样得到的啊?
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gg816 Usually amount unit will be used, though concentration unit will not compromise. dA1/dt=-ka*A1dA2/dt=ka*A1+k21*A3-(k12+k10)*A2 (Please note, there is no F)dA3/dt=k12*A2-k21*A3k10=CL1/V1k12=CL2/V1k21=CL2/V2Good luck
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kingsun出手，给出正解。各个软件，不同算法，如果按照kingsun指定的模型和权重，均获得了比较好一致的拟合结果。
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gg816 Usually, amount unit will be used, though concentration unit will not compromise. dA1/dt=-ka*A1dA2/dt=ka*A1+k21*A3-(k12+k10)*A2 (Please not, there is no F)dA3/dt=k12*A2-k21*A3k10=CL1/V1k12=CL2/V1k21=CL2/V2Good luck若用如上方程，需要求算的参数有：ka,k21,k12,k10,Cl1,Cl2,(或v1,v2)上面的只给出了中央室（也就是1室）的浓度时间变化的点，在这种情况下，V2(周边室或2室)的体积是没有办法估算的，也就是上面的方程没有解。这是口服给药，从0室转运到1室的过程，药物是有损失的（肠壁代谢、肝脏受过代谢、或者肠道水解等），不知您这里不考虑生物利用度F，为什么？与您探讨。ShinerNM的问题还在。。。
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