南通市住房公积金管理中心为市政府直属副处级事业单位承担着全市行政区域内住房公积金管理运作的职能。中心内设综合科、信息技术科、归集管理科、资金运作科、会计核算科、财务审计科、监察室、行政服务处、政策法规科、客户服务中心以及崇川区办事处、开发区办事处、港闸区办事处、政务中心办事处、通州湾办事處和通州、海安、如皋、如东、海门、启东六个经办网点。主要职责为：一、编制、执行住房公积金的归集、使用计划； 二、负责记载住房公积金的缴存、提取、使用等情况；三、负责住房公积金的核算；四、审批住房公积金的提取、使用；五、负责住房公积金的保值、增徝和归还；六、编制住房公积金归集、使用计划执行情况的报告；七、负责对住房公积金经办银行业务上的管理；八、承办住房公积金管悝委员会决定的其他事项