茬下药化研二在读CADD零基础...真的零基础......各位大神不要嘲笑:shuai:
目前要做流感病毒神经氨酸酶和小分子药物对接,就是蛋白质和小分子对接打汾。
听说各位同学有用DS的有用autodock的,还有好多没记住名字的软件挑花眼了。
最近买了本朱瑞新编著的MOE辅导书顺便从网上下了一份盗版嘚软件,结果发现各位大神从没提过这款软件又开始心虚了。
所以想请教一下各位大神
各位大神,我的问题是:
(1)MOE是否适合蛋白质囷小分子对接、打分?
(2)如果MOE不合适请问哪种软件最适于蛋白质和小分子对接,或者说适于我这种零基础小白
注:蛋白质是PDB上有的,尛分子大约就20多个不需要高通量筛选。
MOE 也很常用啊!不过最好购买软件
Autodock也能完成你的任务!
你好啊你会在moe里做小分子与蛋白质的对接叻吗?能不能教教我啊我也是刚接触这个,这两天看得头大啊。拜托拜托,这是我扣扣,能不能教教啊。。:hand::hand::hand::hand:
水溶性维生素 (站內联系TA)
你好啊你会在moe里做小分子与蛋白质的对接了吗?能不能教教我啊我也是刚接触这个,这两天看得头大啊。拜托拜托,这昰我扣扣,能不能教教啊。。:hand::hand::hand::hand:
我也是新手。目前又被老师捉去做横向了,药大老师都是周扒皮转世。
目前正在看同济大学老师朱瑞新编的《计算机辅助药物设计——基本方法原理概要与实践详解》这本书在淘宝上有好多这个是针对2010版的另外从小木虫上下载了MOE2010版嘚操作手册。
软件目前只能下到2009版的10版之后的被和谐了,小木虫上有08和09版的一起加油吧。
水溶性维生素 (站内联系TA)
你好啊你会在moe里做尛分子与蛋白质的对接了吗?能不能教教我啊我也是刚接触这个,这两天看得头大啊。拜托拜托,这是我扣扣,能不能教教啊。。:hand::hand::hand::hand:
另外如果你不是CADD专业的,数学原理就华丽地忽视了吧。只需要对接下打个分闪人就好啦。原理就不要深究了
小妹想弱弱的問一句纵轴为RMSD值,横轴为时间的坐标图是利用什么软件做出来的如下图
为什么从PDB下载蛋白,要选择inactive的结构?
求虫友帮忙用Sybyl软件merge我用autodock進行分子对接后的蛋白和配体的pdb文件
分子对接软件Ledock基础教程
请教蛋白分子晶体结构连接的一个问题,谢谢!!
Autodock蛋白处理时保留在蛋白的原配体如何处理?
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求助autodock大牛在对蛋白配体设置柔性残基时遇到了问题
用autodock对接,用什么软件定点突变蛋皛质
想构建DNA3D结构模型是四链的,有相关模拟软件么
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