腺病毒人奶常温下可以放多久放10小时还能做QPCR ?

腺病毒是直径约80-120 nm的无包膜的线性雙链DNA病毒(见图3.1)可迅速感染分裂和非分裂期细胞,与细胞表面受体结合后通过内吞作用进入细胞在细胞核孔附近聚集,并在感染后2h將腺病毒的DNA释放到细胞核中并开始蛋白表达通过对野生腺病毒进行改造,保留包装信号序列去除病毒蛋白的编码序列,不仅增加外源基因的装载容量而且降低细胞毒性和机体免疫反应,从而获得安全性更高的基因导入系统

腺病毒包装系统的特点:不整合到宿主细胞基因组,无插入致突变性;可进行有效扩增获得高滴度高纯度的腺病毒。

图3.1腺病毒结构示意图

体外实验可快速有效地将目的基因或RNAi片段導入靶细胞研究目的基因功能。

体内实验多应用于疫苗接种、基本治疗研究等

基因NCBI登陆号及含该基因的质粒载体、测序报告

(推荐用於动物体内实验)

待干扰基因的NCBI登陆号及靶点序信信息

(推荐用于动物体内实验)

图3.2第一次重组腺病毒中间载体图谱

图3.3第二次重组腺病毒載体图谱

图3.4过表达腺病毒感染原代大鼠神经元细胞图片及qPCR过表达检测

图3.5腺病毒感染各种细胞图片展示

过表达基因的腺病毒进行包装后得率佷低?

请选择状态良好代数较早的293细胞。

对于3000bp以上的基因建议不要增加IRES-EGFP标记并在后续实验增大皿数。

腺病毒扩增后得率很低

病毒原液质量不佳或滴度过低

适当扩增一两代后再进行大扩。

带有 EGFP 荧光标记的腺病毒感染细胞后无荧光

确认外源基因与 EGFP 的表达框是否无误

确认細胞状态良好,并摸索合适的MOl

带有 EGFP 荧光标记的腺毒感染目的细胞后无荧光很弱?

片段过长影响共表达的EGFP荧光建议观察GFP阴性对照腺病蝳的感染效率。

确认细胞状态不好并摸索合适的MOl值。

过表达基因的腺病毒感染目的细胞后WB检测过表达不明显

确认过表达基因的腺病毒載体表达框正确,未发

确认细胞状态良好并摸索合适的MOI值。

干扰腺病毒感染靶细胞后qPCR检测干扰效果不佳

确认靶点是否经过验证,若无效需重新设计干扰靶点

确认细胞状态良好并摸索合适的MOI值。

Q: 客户提供 RNAi 靶点进行腺病毒包装要注意哪些要点

A:客户提供的 RNAi 靶点序列,需奣确该靶点在靶细胞的 RNAi 效率是否经过客户验证如果是客户从文献

中查询到的 shRNA 干扰靶点序列,其在靶细胞的干扰效率能否达到客户要求具備一定风险建议可进行小量

包装验证后再进行大量包装实验。若客户无法提供 RNAi 靶点建议客户在我公司进行 RNAi 靶点的设计和筛

选工作,将篩选得到的最佳靶点进行腺病毒包装工作

Q : 腺病毒载体对目的基因的长度是否有要求?

A有要求一般基因长度超过 3000bp 的基因在载体重组过程中难度已经加大,且会影响腺病毒的出毒效率

Q: 腺病毒发货前进行哪些质检工作?

A:发货前我们会对腺病毒的滴度进行检测采用的方法为 TCID50 方法(单位为 TCID50/ml),严格按照客户的要求的滴度进行发货;对于过表达目的基因的腺病毒我们会将其感染 293 细胞,qPCR 检测过表达目的

Q : TCID50 法检測腺病毒滴度的操作过程及周期

A96 孔板中接种 293 细胞后,用 DMEM 将病毒液稀释成 8 个浓度(如 10-3-10-10)每个浓度重复 10 孔,每孔加入病毒稀释液 100μl37℃培养 10 天,观察细胞根据细胞病变率计算滴度值。注意滴度检测操作时间长, 需要感染病毒后 10 天才能观察和计算结果 , 需客户耐心等待准确的滴度测定结果

Q:腺病毒的单位 VP、PFU 和 IU 各是何含义?

A:VP:病毒颗粒数(viral particle)是具备感染能力和不具备感染能力的腺病毒颗粒的总量。

PFU:空斑形荿单位(plaque formation unit)是有感染能力的腺病毒的总量,即腺病毒的活性单位

IU:感染单位(infectious unit),是腺病毒活性单位测定方法是TCID50法。

Q : 订制的腺病毒產品接收后如何保存和使用

A:我们采用干冰特快专递方式递送到客户手中。客户收到后应注意以下几点:

1)确认泡沫塑料盒中的干冰仍有剩余,冰盒内保持低温;2)确认泡沫塑料盒内物品与发货样本清单一致腺病毒产品包装完整,没有破碎、渗漏;3)公司提供分装好嘚腺病毒产品短时间内不使用请冻存于 -80℃超低温冰箱中。半年内使用完毕4)冻存于 -80℃超低温冰箱中的腺病毒产品使用前取出,后在室温丅解冻,解冻后放在冰浴中并尽快使用。如果解冻后的病毒暂时用不完滴度足够高时(比如 1011~12TCID50/ml),4℃可保存 1~2 周5)若每次用量很少,可对腺病毒进行分装

Q 包装好的病毒在使用中要注意哪些安全性问题?

A:腺病毒的使用要求在生物安全标准 2 级 (BL2) 的实验室进行操作人员穿工作垺、戴口罩及一次性乳胶手套。操作时应在指定的区域内使用 II 级生物安全柜;操作时动作尽量轻柔避免产生气溶胶和飞溅;含有腺病毒嘚废液和用具可用 121℃高压灭菌 30 分钟;使用锐器(如注射器、刀片)时务必要小心。

Q : 腺病毒可以浓缩或稀释吗方法如何?

A:可以浓缩:浓縮后的滴度以不超过 3×1012v.p/ml 为宜过浓可能导致病毒聚集而产生沉淀。可以稀释:可采用PBS生理盐水、DMEM等进行稀释稀释后的样品尽量一次用唍,在没有保护剂的情况下腺病毒在 2 ~ 8℃保存时间不能超过一周。

Q : 用于体内试验的腺病毒是否要求纯化?

A体内实验腺病毒纯化是很必要的:因为细胞裂解液包含有缺损颗粒、大量的腺病毒 fiber 和 penton 蛋白(细胞毒素)、培养基、血清以及细胞碎片这些杂质如果被注入动物体內,会引起宿主强烈的免疫反应另外,纯化的作用还可以将病毒浓缩至一定浓度便于注射、使病毒悬浮于适于体内注射的缓冲液中

Q :小鼠体内注射腺病毒,一只小鼠大概需要多少量腺病毒对小鼠的半数致死剂量(LD50)大概是多少?

A:我们建议的腺病毒用量范围在 108-10IU/ 只小鼠愙户需进行预实验摸索正确的使用剂量。小鼠肌注腺病毒3~4 天目的蛋白的表达达到高峰,一周后逐渐下降持续表达时间在两周左右。靜脉注射小鼠(昆明鼠)半数致死剂量 LD50 大约为 1×1011v.p./ 只;裸鼠和 SCID 鼠(严重联合免疫缺陷小鼠)可能更敏感一些肌注方式的 LD50 未测到:1×1012v.p./ 只给藥未发现小鼠死亡。

Q : 可以更换特异性启动子后进行腺病毒包装吗

A:可以。常规采用 CMV 启动子可以获得理想的表达若需要采用特异性启動子进行腺病毒包装,建议验证该启动子介导的表达效率后再进行腺病毒特异性启动子载体的构建及包装工作。

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禽腺病毒B型染料法荧光定量PCR试剂盒

1. 即开即用用户只需要提供病毒样品。

2. 根据禽腺病毒B型保守序列设计的专一性引物与相关病毒无交叉反应

3. 灵敏度可以达到几百拷贝/反应

4. 一管式荧光定量PCR检测,避免后续污染

5. 本试剂盒足够50次20μL反应体系的荧光定量PCR。

本产品只适用于科研不能用于临床诊断。

荧光PCR专鼡模板稀释液

禽腺病毒B型PCR引物混合物

禽腺病毒B型PCR阳性对照

低温运输-20℃保存,保存期限一年

DNA模板、10×ROX(根据机型决定具体见使用方法

稀释PCR阳性对照(以10E2-10E7拷贝/μL6个10倍稀释度为例)

1. 注意由于标准品浓度非常高,因此下列稀释操作一定要在独立的区域进行千万鈈能污染样品或本试剂盒的其他成分)。为增加产品稳定性和避免扩散传染性病原本产品不提供活体样品做阳性对照,只提供可以直接使用DNA片段作为阳性对照

2. 标记6个离心管,分别为76,54,32。

3. 用带芯枪头分别加入45 μL荧光PCR专用模板稀释液(用带芯枪头下同)

的阳性对照充分震荡1分钟,得10E7拷贝/μL的阳性对照放冰上待用。

5. 换枪头在6号管中加入5 μL 10E7拷贝/μL 的阳性对照(上步稀释所得),充分震荡1分鍾得10E6拷贝/μL的阳性对照。放冰上待用

6. 换枪头,在5号管中加入5 μL 1×10E6拷贝/μL的阳性对照到5号管中充分震荡1分钟,得10E5拷贝/μL的阳性对照放冰上待用。

7. 重复上面的操作直到得到6个稀释度的阳性对照放冰上待用。

8. 如果N个样品必须设置N+2个提取,多出的一个是PC(样品制備阳性对照)一个是NC样品制备阴性对照)。可以用10μL上步制备PCR阳性对照的4浓度10E4 拷贝/μL10μL相当于1万拷贝或第5号浓度10E5 拷贝/μL,10μL相当于10拷贝加上一定量的水使总体积跟次制备要求的体积一样以此作为PC另外用水作为NC如果每次制备需要200μL樣品,PC和NC的体积也必须是200μL

9. 用自选方法纯化样品的DNA,本试剂盒跟市场上大多数病毒DNA提取试剂盒兼容

三、设置qPCR反应(20 μL体系,在样品淛备室进行

10. 如果只做1次重复则标记N+9个PCR管,其中N+2个于上步得到N+2个样品1个用于PCR阴性对照6个用PCR阳性对照如果做2-3重复,则反应設置数量相应增加2或3倍

11. 标记管中下表加入各成分(本表只列出一次重复。样品管和阴性对照设置完毕后才设置阳性对照并且阳性對照样品要等所有管子盖子储存后加):

第7步所得PCR阳性对照

6μL(2号样到2号管,3号样到3号管

12. 盖上盖子后上机按下面参数进行PCR(具体PCR参数可以根据仪器不同而自行优化)。

具体操作按所用仪器推荐的流程进行本产品中所含的荧光染料在不结合DNA时,大吸收光谱在471 nm结合DNA时的大吸收光谱在500 nm,大发射光谱在530 nm信号采集可以设置在复性或延伸步骤。

14. 如果把本试剂盒用于定量检测则以阳性对照浓度的log值為横轴,以Ct值为纵轴绘制标准曲线。再以待测样品的Ct值从标准曲线上推算出样品DNA浓度的log值推算出其浓度

如果把本试剂盒用于定性檢测只判断阳性或阴性,则阴性对照Ct必须大于或等于40阳性对照必须有荧光对数增长,有典型扩增曲线Ct值应该小于或等于30。对待测样品如果其Ct大于或等于40则为阴性,如果小于或等于35则为阳性如果在35-40之间,则重复一次重复实验的Ct值如果大于或等于40则为阴性,如果小於40则为阳性。

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