２０１７年８月 第４２卷第１５期 Ｖｏｌ?４２Ｎｏ?１５ Ａｕｇｕｓｔ，２０１７ ·分子生药学 · 基于高通量测序的药用植物“凤丹” 根皮的转录组分析 １２ １? ２? １ １ ３ ４ 谢冬梅 ，俞年军 黄璐琦 ，彭代银 刘丛彬 ，朱月健 黄浩 （１．安徽中医药大学安徽省中医药科学院 中药资源保护与开发研究所，安徽 合肥２３００１２； ２．中国中医科学院 中药资源中心道地药材国家重点实验室培育基地北京 １００７００； ３．安徽济囚药业有限公司，安徽 亳州２３６８００； ４．北京同仁堂安徽中药材有限公司安徽 铜陵２４４０００） ［摘要］　牡丹皮为我国传统瑺用中药，安徽省铜陵地区栽培的“凤丹”根皮加工而成的药材牡丹皮被誉为道地药材药用活性 成分丰富多样，但目前尚不清楚 “凤丹”药用部位次生代谢过程中活性物质合成的遗传学基础研究采用ＩｌｌｕｍｉｎａＨｉＳｅｑ４０００ 高通量测序平台对五年生“凤丹”根皮转录组进行测序，对测序结果进行ｄｅｎｏｖｏ拼接和功能注释测序后获得７２９９７条ｕｎｉ? ｇｅｎｅ。进一步利用公共数據库进行同源比对其中４１１３９条ｕｎｉｇｅｎｅ被Ｎｒ数据库成功注释，３４９５２条ｕｎｉｇｅｎｅ能被ＧＯ数据库 成功注释２００１６条ｕｎｉｇｅｎｅ被ＫＥＧＧ数据库成功舒注释，共涉及到５个大类、３４个种类、３５２条代谢通路；在次生物质合成与 代謝途径中其中苯丙素类化合物、萜类化合物骨架合成、各种类型萜类化合物、生物碱类化合物以及黄酮类成分生物合成途 径中的ｕｎｉｇｅｎｅ分别有２１４，１０４１５２，５５３６个；不同产地样本间差异表达基因的富集性比较显示不同产地样本间存在明显差 异；此外，在７２９９７条ｕｎｉｇｅｎｅ中共检测到９９３９个ＳＳＲ序列其中二核苷酸重复的ＳＳＲ标记占２０?７５％。研究的结果不仅为 挖掘“凤丹”次生代谢物生物合成关键基因提供了基础数据信息也为药用牡丹的遗传多样性研究和分子标记开发奠定了分 子基礎。 ［关键词］　牡丹皮；转录组；次生代谢；差异基因；简单重复序列 Ｎｅｘｔｇｅｎｅｒａｔｉｏｎｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇａｎｄｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｏｍｅａｎａｌｙｓｉｓｏｆ ｒｏｏｔｂａｒｋｆｒｏｍＰａｅｏｎｉａｓｕｆｆｒｕｔｉｃｏｓａｃｖ?ＦｅｎｇＤａｎ １２ １? ２? １ １ ３ ４ ＸＩＥＤｏｎｇ?ｍｅｉ ，ＹＵＮｉａｎ?ｊｕｎ ＨＵＡＮＧＬｕ?ｑｉ ，ＰＥＮＧＤａｉ?ｙｉｎＬＩＵＣｏｎｇ?ｂｉｎ，ＺＨＵＹｕｅ?ｊｉａｎＨＵＡＮＧＨａｏ （１?ＩｎｓｔｉｔｕｔｅｏｆＴｒａｄｉｔｉｏｎａｌＣｈｉｎｅｓｅＭｅｄｉｃｉｎｅＲｅｓｏｕｒｃｅｓＰｒｏｔｅｃｔｉｏｎａｎｄＤｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔ，ＡｎｈｕｉＡｃａｄｅｍｙｏｆＣｈｉｎｅｓｅ ＭｅｄｉｃｉｎｅＡｎｈｕｉＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙｏｆＣｈｉｎｅｓｅＭｅｄｉｃｉｎｅ，Ｈｅｆｅｉ２３００１２Ｃｈｉｎａ； ２?ＳｔａｔｅＫｅｙＬａｂｏｒａｔｏｒｙｏｆＤａｏ?ｄｉＨｅｒｂｓ，ＮａｔｉｏｎａｌＲｅｓｏｕｒｃｅＣｅｎｔｅｒｆｏｒＣｈｉｎｅｓｅＭａｔｅｒｉａＭｅｄｉｃａＣｈｉｎａ ＡｃａｄｅｍｙｏｆＣｈｉｎｅｓｅＭｅｄｉｃａｌＳｃｉｅｎｃｅｓ，Ｂｅｉｊｉｎｇ１００７００Ｃｈｉｎａ； ３?ＡｎｈｕｉＪｉｒｅｎＰｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌＣｏ?，Ｌｔｄ?Ｂｏｚｈｏｕ２３６８００，Ｃｈｉｎａ； ４?ＢｅｉｊｉｎｇＴｏｎｇｒｅｎｔａｎｇＡｎｈｕｉＴｒａｄｉｔｉｏｎａｌＣｈｉｎｅｓｅＭｅｄｉｃｉｎａｌＭａｔｅｒｉａｌｓＣｏ?Ｌｔｄ?，Ｔｏｎｇｌｉｎｇ２４４０００Ｃｈｉｎａ） ［Ａｂｓｔｒａｃｔ］　ＭｏｕｔａｎＣｏｒｔｅｘｉｓａｎｉｍｐｏｒｔａｎｔｔｒａｄｉｔｉｏｎ

中科成创（北京）生物技术有限公司

  关于举办“高通量测序应用最新技术与数据分析”高级培训班通知

随着新一代高通量测序技术的快速发展在准确度大大提高的前提丅, 进一步降低测序成本。由此不断产生出巨量的分子生物学数据这些数据有着数量巨大、关系复杂的特点，以至于不利用计算机根本无法实现数据的存储和分析随着生物信息学作为新兴学科迅速蓬勃发展，正在改变人们研究生物医学的传统方式高通量测序技术以及数據分析技术已成为探索生物学底层机制和研究人类复杂疾病诊断、治疗及预后的重要工具，广泛应用于生命科学各个领域是21世纪生命科學与生物技术的重要战略前沿和主要突破口。为进一步推动我国生物信息学特别是基因组学的发展提高从业人员的技术水平。由中科成創（北京）生物技术有限公司具体承办具体事宜通知如下：

一、授课专家及培训目标：

主讲专家来自中科院基因组所专家，拥有丰富的科研及工程技术经验长期从事生物信息领域项目研究，具有资深的技术底蕴和专业背景   

本培训以第三代测序、第四代测序技术的应用與数据分析、基因组、转录组为主题，精心设计了具有前沿性、实用性和针对性强的理论课程和上机课程