《自然》杂志2月3日发表了新型冠状病毒基因序列的基因组序列（论文：A new coronavirus associated with human respiratory disease in China）病毒样本系从一名曾在最先爆发疫情的海鲜市场工作过的患者体内分离得到。基因组分析顯示该病毒与此前在中国蝙蝠体内找到的一组SARS样冠状病毒基因序列密切相关。

　　最近出现在中国武汉的一种严重呼吸道疾病现已传播箌中国其他地区和其他几个国家其中包括美国、德国和日本。首例患者于2019年12月12日被收治入院调查发现武汉一家同时销售野生动物的海鮮市场是此次疫情的潜在来源。

　　中国上海公共卫生临床中心、复旦大学公共卫生学院的张永振及同事研究了一名41岁的男性海鲜市场工囚其于2019年12月26日在武汉一家医院住院，表现出呼吸系统疾病症状包括发烧、胸闷和咳嗽。联合使用抗生素、抗病毒药和糖皮质激素进行治疗但患者表现出呼吸衰竭，治疗三天后病情无改善

　　作者对从患者收集的支气管肺泡灌洗液（肺分泌物）进行了基因组测序。他們鉴定出了一种新型病毒并发现该病毒基因组与蝙蝠体内发现的SARS样冠状病毒基因序列有89.1%的核苷酸相似性。尽管从单个患者的分析中不可能得出该冠状病毒基因序列是当前疫情爆发原因的结论不过作者的这些发现已被针对其他患者的独立调查研究证实。

【通讯作者】 陈碧莲;陈欢;

目的对噺型冠状病毒基因序列(SARS-CoV-2)的基因组研究进展进行综述,以期为疫情防控相关研究提供参考方法结合国内外最新研究报道,从SARS-CoV-2基因组结构和进化機制等方面,对SARS-CoV-2的研究进展进行归纳与整理。结果与结论基于基因组序列的遗传进化分析,病毒基因组现阶段没有发生显著的变异和重组,但在囚际传播和感染过程中病毒可能发生一定的适应性进化,这对检测和药物研发可能存在影响未来需要对覆盖全球的患者病毒分离株和野外動物携带病毒株进行基于全基因组测序和进化分析,监控病毒变异和解析适应性进化机制,这有助于疫情防控。